Para inutilizar numerações de NFe, seguir os passos abaixo:
No painel NFe, acesse: Notas Fiscais -> Inutilizar faixa de numeração.
A janela abaixo será exibida:
Informe a série fiscal, o número inicial, e final. (Caso seja apenas 1 número, repita o mesmo, em ambos os campos).
Clique em pesquisar. O filtro deve ser exibido logo abaixo.
Selecione, e clique em Inutilizar.
Informe o motivo da inutilização, com no mínimo 15 caracteres.
Informe a senha do certificado digital.
Após isso, a numeração estará devidamente inutilizada.